مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

Authors

محمد تیموریان

محمد مهدی شریعتی

علی اصغر اسلمی نژاد

abstract

انتخاب ژنومی، ارزش­های ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب داده­های ژنومی و فنوتیپی با استفاده از مدل­های آماری پیش­بینی می­کند. صحت پیش­بینی ارزش­های ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشان­گری در جمعیت مرجع از آن استفاده می­شود، از عوامل مؤثر بر صحت پیش­بینی­ها می­باشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشان­گری، جمعیت مرجع و معماری ژنتیکی صفت بر انتخاب بهترین مدل آنالیز تاثیر­ گذارند. در این مطالعه، گاوهای هلشتاین ایران شبیه­سازی و مدل­های مختلف آنالیز در انتخاب ژنومی این جمعیت بررسی شدند. مدل­ gblup و چهار مدل­ بیزی a، b، lasso و  در حالت­های مختلفی از جمعیت مرجع، تعداد جایگاه­های صفت کمی (qtl) و تراکم نشان گری مقایسه شدند. روش­های بیزی نسبت به روش gblup صحت برآورد بالاتری داشتند و این برتری در حالت کم بودن تعداد ژن­های بزرگ اثر و استفاده از اطلاعات جمعیت­های دیگر در تشکیل جمعیت مرجع ایران بیشتر بود. برای انتخاب ژنومی در جمعیت گاوهای هلشتاین ایران، به کارگیری مدل بیز b در جمعیت مرجعی شامل گاوهای نر و ماده و بهره­گیری از اطلاعات جمعیت­های دیگر پیشنهاد می­گردد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مقایسه دو روش آماری مختلف در برآورد مؤلفه‌های (کو)واریانس صفات تولیدی گاوهای هلشتاین ایران

هدف این مطالعه مقایسه روش¬های آماری حداکثر درست نمایی محدود شده و بیزی در ارزیابی مؤلفه‌های (کو)واریانس صفات تولیدی گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از مدل حیوانی رگرسیون تصادفی چند صفتی بوده است. داده¬ها شامل 181226 رکورد روز آزمون نخستین دوره شیردهی جمع¬آوری شده از 21469 گاو شیری بود. مدل شامل گله- سال- فصل زایش، سال- ماه رکورد برداری، نمره سلول¬های بدنی، سن در موقع زایش، و تعداد دفعات دوشش به...

full text

مقایسه دو روش آماری مختلف در برآورد مؤلفه های (کو)واریانس صفات تولیدی گاوهای هلشتاین ایران

هدف این مطالعه مقایسه روش¬های آماری حداکثر درست نمایی محدود شده و بیزی در ارزیابی مؤلفه های (کو)واریانس صفات تولیدی گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از مدل حیوانی رگرسیون تصادفی چند صفتی بوده است. داده¬ها شامل 181226 رکورد روز آزمون نخستین دوره شیردهی جمع¬آوری شده از 21469 گاو شیری بود. مدل شامل گله- سال- فصل زایش، سال- ماه رکورد برداری، نمره سلول¬های بدنی، سن در موقع زایش، و تعداد دفعات دوشش به...

full text

شبیه سازی جنبه های مختلف انتخاب ژنومی و صحت برآوردها در گاوهای هلشتاین

در انتخاب ژنومی ابتدا برآورد اثرات نشانگری از طریق مدل های مختلف آماری با استفاده از داده های ژنوتیپی و فنوتیپی دام ها در جمعیت مرجع صورت می گیرد و سپس ارزش های ارثی ژنومی دام-های بدون رکورد فنوتیپی فقط بر مبنای ژنوتیپ آن ها و اثرات برآورد شده پیش بینی می گردد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشانگری، تعداد و نوع حیوانات جمعیت مرجع، معماری ژنتیکی صفت یا صفات مورد مطالعه و مدل آماری آنالیزها بر صحت پیش...

توزیع سنی و فاصله نسل در مسیرهای مختلف انتخاب در گاوهای هلشتاین ایران

با استفاده از داده‌های جمع‎آوری شده از دام‎های تحت پوشش مرکز اصلاح نژاد دام کشور، میانگین توزیع سنی جمعیت و فاصله نسل در چهار مسیر مختلف انتخاب در گاوهای هلشتاین یعنی پدر پدران آینده (SS)، پدر مادران آینده (SD)، مادر پدران آینده (DS) و مادر مادران آینده (DD) و نیز مسیر گاوهای نر جوان (YB) که در واقع بخشی از مقدار فاصله نسلی در مسیر SD در زمان استفاده از برنامه آزمون نتاج را تشکیل می‎دهد، مورد ب...

full text

بررسی شاخص سلامت پستان و مقایسه استراتژی‌های مختلف انتخاب جهت گنجاندن اطلاعات این صفت در برنامه‌های اصلاحی گاوهای هلشتاین ایران

پارامترهای ژنتیکی و فنوتیپی مربوط به صفات تولیدی، ساختار پستان و تعداد سلول‌های بدنی (somatic cell count) برای گاوهای هلشتاین ایران برآورد گردید. رکوردهای ماهیانه تعداد سلول‌های بدنی (SCC) در ابتدا تبدیل به امتیاز سلول‌های بدنی(SCS) شد و پس از آن سنجه میانگین دوره شیردهی این صفت (LSCS) با تصحیح برای حجم شیر محاسبه گردید. با استفاده از این برآوردها یک شاخص سلامت پستان برای گاوهای هلشتاین ایران پ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
پژوهش های تولیدات دامی

جلد ۷، شماره ۱۴، صفحات ۲۰۳-۱۹۸

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023